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SNP基因分型检测技术服务

服务编号:BIOFW102

服务简介

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP),即染色体基因组中单个核苷酸的突变而引起的 DNA 序列的多态性,它以单个碱基的颠换、转换、插入和缺失等形式存在。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为21SNP CG序列上出现较为频繁,而且多是C转换为T,原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自发地脱氨成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于1 %的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP,人类基因组上的SNP总量大概是3×10^6个。因此,SNP成为遗传标志,人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。

SNP研究是人类基因组计划走向应用的重要步骤。大量存在的SNP位点,使人们有机会发现与各种疾病,包括肿瘤相关的基因组突变。研究发现,人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都与SNP有关。

基于过硬的引物合成及标记技术,多重PCR扩增技术,测序技术,本公司推出多种SNP分型服务的方法:直接测序方法、多重SNaPshot SNP方法、以及Taqman探针设计合成,为广大客户提供多样的选择。涵盖了对血液、组织、口腔、细菌、真菌样品gRNA提取及分型技术服务。

 

常用方法

1 直接测序法

技术原理:将待检测片段进行PCR扩增并直接测序,是SNP检测方法中准确的方法。纯合位点为单峰,而杂合峰为套峰,因而很容易将几种基因型区分开来。直接测序法不仅可用于对已知位点的检测,还可用于发现未知的SNP位点。

2 KASP分型法

技术原理:KASPKompetitive Allele Specific PCR,竞争性等位基因特异性PCR)只需要设计并合成普通扩增引物,并利用分别带有FAMHEXBHQ1修饰的通用探针引物即可实现对基因多态性位点的检测。该方法不仅可以检测SNP多态性位点,对插入缺失和特定的基因组中甲基胞嘧啶都可以实现检测。该方法不仅缩短了基因多态性检测周期,同时也大大降低了检测成本。

3 连接酶检测反应(LDR)分型方法

技术原理:主要应用连接酶检测反应((igase detection reactionLDR)技术。即在Taq DNA连接酶的作用下,当左右两条索核苷酸探针与目的DNA序列完全互补,并且两条探针之间没有空障时才能发生连接反应,否则连接反应不能进行,通过荧光扫描片段长度,实现对SNP位点的检测。

4 多重SNaPshot SNP分型方法

技术原理:SNaPshot SNP分型是一种以单碱基延神原理为基础,同时利用多重PCR对多个已知SNP位点进行遗传分型的方法。在一个含有测序酶,四种荧光标记的ddNTP,紧挨多态位点5'端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经测序仪跑胶后,根据峰的颜色可知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型,根据峰移动的胶位置确定该延伸产物对应的SNP位点。

5 Taqman 探针方法

技术原理:在PCR反应系统中加入2种不同荧光标记的探针,它们可分别与2个等位基因完全配对。正常情况下,由于探针5'端荧光基团和3端淬灭基团紧邻在一起,荧光被淬灭。随着PCR的有效进行,与模板完全配对的探针逐步被Taq DNA聚合酶5'-→3'外切酵活性切割,致使探针5端上的荧光基团与3'端的淬灭基团分离,淬灭效应解除,报告荧光基团被激活;而与模板不能完全配对的探针(代表另一种等位基因)不能被有效切割,故检不到荧光信号,通过相应仪器检测荧光值的变化即可实现SNP位点检测。

 

应用领域

表型变异/疾病遗传机制研究

复杂疾病易感基因定位

基因检测

个体化治疗

特定人群的遗传分析,人群进化史研究

 

服务优势

百欧泰团队具有成熟检测经验,可提供多种服务优势:

分型准确,其准确度达99.9%

可多位点同时检测

不受SNP位点多态特性限制

不受样品个数的限制

专业性强:可根据客户实验具体分析,满足不同的实验需求,提供多种文库构建服务;

专业的技术支持,保障强力、周到的售前售后服务支持,随时为您解答出现的任何问题

 

 

服务流程

双方沟通一致后确定实验方案,确定服务要求-签订合同—预付款-开始实验-成果交付

 

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