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Label-free定量蛋白服务

服务编号:BIOLY001

服务简介

Label-free定量蛋白质组学是一种无需同位素标记,直接通过质谱信号强度(如肽段母离子强度或谱图计数)进行相对定量的强大技术。该方法简化了实验流程,降低了成本,特别适合复杂样本、大规模队列研究或难以标记样本的蛋白质组深度分析。其核心在于高分辨率、高灵敏度的质谱仪和强大的生物信息学分析能力。

百欧泰采用国际领先的timsTOF Pro 2质谱平台,将Label-free定量技术带入4D新时代。在传统三维数据(保留时间、质荷比、离子强度)的基础上,timsTOF Pro 2创新性地引入了离子淌度(Ion Mobility Spectrometry, IMS) 作为第四维分离维度。离子淌度根据离子在电场中与缓冲气体碰撞时的形状(碰撞截面积,CCS)进行分离,显著提高了复杂样本中肽段的分辨率、检测灵敏度和定量准确性。


技术原理

timsTOF Pro 2 的核心创新在于其双TIMS(捕集离子淌度分离)技术:

1.离子累积与分离并行化:离子在第一个TIMS装置中进行累积。

2.淌度分离:累积的离子被传输到第二个TIMS装置中,根据其淌度(碰撞截面积,CCS)进行高效分离。

3.高效碎裂:经过淌度分离后的离子进入高灵敏度TOF质量分析器进行MS/MS碎裂。

4.近乎100%占空比:当第二个TIMS正在进行淌度分离和后续MS/MS分析时,第一个TIMS已经在平行地累积下一批离子。这种“并行操作”模式实现了近乎100%的离子利用率,大幅提升了检测灵敏度和扫描速度,特别适合复杂生物样本的深度覆盖和准确定量。


分析流程

【百欧泰生物】.png


样品要求

客户提供

要求

细胞/组织裂解液

提供总蛋白量 ≥ 100 μg (推荐 ≥ 200 μg),浓度 ≥ 1 μg/μL。溶解于兼容质谱的裂解液(如SDC或RapiGest),避免使用高浓度去垢剂(如SDS)、盐分(如NaCl, EDTA, Tris)、甘油、核酸等干扰物。样本需干冰寄送。

体液(血清/血浆)

提供体积 ≥ 50 μL (推荐 ≥ 100 μL)。需明确处理方法(如高丰度蛋白去除)。避免溶血。样本需干冰寄送。

蛋白溶液

提供总蛋白量 ≥ 100 μg (推荐 ≥ 200 μg),浓度 ≥ 1 μg/μL。缓冲液要求同上。样本需干冰寄送。

SDS-PAGE胶条/点

提供足量胶条,需明确目标条带/点位置。干冰寄送。


服务优势

1.无标记,更灵活:无需同位素标记,实验设计更简单,成本更低,适用于几乎所有生物样本类型(细胞、组织、体液、FFPE等)。

2.4D分离,深度覆盖: 基于timsTOF Pro 2的4D(保留时间、质荷比、离子强度、离子淌度)分离技术,显著提升复杂样本中低丰度肽段的分离能力和检测灵敏度,实现更深度的蛋白质组覆盖。

3.超高灵敏度与速度: 双TIMS设计实现近乎100%离子利用率,配合高扫描速度,可在单针分析中鉴定和定量数千种蛋白质。

4.高定量准确性: 离子淌度分离有效降低背景干扰,提高谱图质量,结合先进的定量算法(如MaxQuant, Spectronaut, DIA-NN),确保定量的稳定性和重复性。

5.强大的生信分析: 提供从原始数据到生物学洞见的完整分析流程,包括严格质控、深度定性定量、差异分析、功能注释(GO, KEGG, COG, 结构域)、互作网络、多组学关联等。

 

经验丰富的团队: 拥有资深蛋白质组学专家和技术人员,确保实验操作规范、数据分析精准可靠。


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